Hyperspectral imaging for presumptive identification of bacterial colonies on solid chromogenic culture media
author：Mathilde Guillemota,Rony Midahuena,?Delphine Archenyb,Corine Fulchironb,Regis Montvernaya,Guillaume Perrina,?Denis F. Leroux*a??aTechnology Research?Department,?Innovation Unit,bioMérieux SA,?Marcy l’Etoile,?France；?bR&D ?Microbiology,bioMérieux SA,?La Balme les Grottes,France
BioMérieux致力于研究自動化微生物學實驗室，以降低成本 (更少的人力和耗材), 提升性能 (提升靈敏度,機器算法)，并通過優化臨床實驗室工作流，獲得可追溯性。在這項研究中， 我們評估了采用高光譜成像技術（HIS）代替人類視覺觀測微生物培養解讀的可能性。在顯色培養基中培養24小時后，通過分析，微生物菌落從19種被過濾細分為6種顯色種類(chromID? CPS Elite, bioMérieux, France)。高光譜成像技術在400-900納米光譜區域采用線陣掃描分析，利用線性混合像元分解算法，并使用專門的漫反射光譜（DRS）作為輸入數據，我們采用完全自動化的方法，獲得組內100%的分類精度，并沒有采用形態信息。為了簡化儀器，我們采用了判別力最強的14個光譜通道（多光譜模型之一）或者3個通道（RGB圖像模型）評估退化的DRS性能。結果發現，多光譜模型的整體分類性能保持不變，但RGB預測模型退化，這意味著，多光譜解決方案將會帶來改善菌落識別的答案。
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文獻來源：Leroux ProcSpie98873L.pdf